Проблемы с вертикальной синхронизацией в видео это давняя проблема карточек ati. Если раньше помогала галочка Vblank в compiz, то в ubuntu 11.04 эта галочка вызывает нехилые тормоза всего компиза.
Что бы решить проблему с горизонтальным смещением видео нам понадобятся проприаретарный драйвер. После установки заходим в ATI Catalyst Control Center > Display Options > Tear free и ставим точку на Enable и жмём Apply.
По умолчанию в ubuntu 11.04 галочка уже стоит на вертикальной синхронизации в компизе. Не забудьте её снять(Она находиться во вкладке OpenGL)
Перезагружать компьютер не надо, можете проверить, полос в видео уже нет :)